（1）提高土壤肥力。這是微生物肥料的主要功效，例如各種自生、聯(lián)合或共生的固氮生zd物肥料，可以固定空氣中的氮素，增加土壤中的含氮量；多種分解磷鉀礦物的微生物，如硅酸鹽細(xì)菌能分解土壤中的鉀長(zhǎng)石、云母及磷礦石，使其中難溶的磷、鉀有效化。（2）制造和協(xié)助農(nóng)作物吸收營(yíng)養(yǎng)。有些菌肥施用后，由專于微生物的活動(dòng)，不僅能增加土壤有效養(yǎng)分，還能產(chǎn)生多種激素類(lèi)物質(zhì)和各種維生素，從而促進(jìn)作物的生長(zhǎng)；根瘤菌肥中的根瘤菌向豆科植物一生提供的氮素占其一生需要量的30%～80%；VA菌根是一種土壤真菌，它可以與多種植物根共生，其菌絲伸出根部很遠(yuǎn)，屬可以吸收更多的營(yíng)養(yǎng)供各種植物利用，其中以對(duì)磷的吸收最為明顯。

生物肥料亦稱生物肥、菌肥、細(xì)菌肥料或接種劑等，但大多數(shù)人習(xí)慣叫菌肥。確切地說(shuō)，生物肥料是菌而不是肥，因?yàn)樗旧聿⒉缓兄参锷L(zhǎng)發(fā)育需要的營(yíng)養(yǎng)元素，而只是含有大量的微生物，在土壤中通過(guò)微生物的生命活動(dòng)，改善作物的營(yíng)養(yǎng)條件。 目前，市場(chǎng)上出現(xiàn)的各種生物肥料，實(shí)際上是含有大量微生物的培養(yǎng)物。它們可以是粉劑或顆粒，也可以是液體狀態(tài)。將它們施到土壤里，在適宜的條件下進(jìn)一步生長(zhǎng)、繁殖，一方面可以將土壤中某些難于被植物吸收的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)轉(zhuǎn)換成易于吸收的形式，另一方面可以通過(guò)自身的一系列生命活動(dòng)，分泌一些有利于植物生長(zhǎng)的代謝產(chǎn)物，刺激植物生長(zhǎng)。含固氮菌的菌肥還可以固定空氣中的氮素，直接提供植物養(yǎng)分，不過(guò)目前各種菌肥能固定的氮素?cái)?shù)量十分有限。

生物菌肥又稱菌肥，微生物菌肥，生物肥，例如：金寶貝微生物菌肥，具有固氮解抄磷解鉀的能力，其內(nèi)襲含有大量有益微生物，其中大量有益微生物能迅速在土壤中以幾何級(jí)數(shù)繁衍擴(kuò)散，以知及功能微生物的代謝產(chǎn)物，能改善土壤的理化性狀，提高親水性、吸附性，增強(qiáng)通透性和保水保肥能力，從面改善作物品質(zhì)，提高產(chǎn)量。目前已經(jīng)有越來(lái)越多的人在使用微生物菌道肥。